產(chǎn)品名稱: AHARIBO PROTEIN System 360 (12 rxns)
品牌: immaginabiotech
規(guī)格:12 rxns
適用物種:真核細(xì)胞系
起始量:10萬細(xì)胞
介紹:用于快速分離和分析新合成蛋白質(zhì)。通過AHARIBO Protein 360技術(shù),您可在活躍的翻譯過程中使用疊氮高丙氨酸(AHA)標(biāo)記新生蛋白質(zhì),并利用磁珠進(jìn)行分離。隨后,只需將樣本寄送至我方實(shí)驗(yàn)室,我們將通過液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)技術(shù)進(jìn)行鑒定。數(shù)周內(nèi),您將收到一份綜合報(bào)告,其中包含樣本中檢測(cè)到的所有新合成蛋白質(zhì)的詳細(xì)信息。
操作流程:
1、樣本制備
無甲硫氨酸培養(yǎng)基培養(yǎng) -> AHA標(biāo)記 -> 細(xì)胞裂解。
2、蛋白質(zhì)下拉實(shí)驗(yàn)
磁珠孵育 ->磁珠洗滌。
3、肽段定量與鑒定
磁珠酶解 ->LC-MS->數(shù)據(jù)分析。
概念驗(yàn)證研究
AHARIBO蛋白360成功分離AHA標(biāo)記肽段
AHA標(biāo)記K562細(xì)胞(AHA+)與未標(biāo)記細(xì)胞(AHA-)的下拉效率對(duì)比
在LC-MS生成的譜圖中,AHA+樣本顯示出顯著的信號(hào)富集,證實(shí)AHARIBO介導(dǎo)的下拉技術(shù)對(duì)AHA標(biāo)記肽段具有高度特異性。
案例研究:
Torin 2治療應(yīng)用
Torin 2作為mTOR通路抑制劑,通過阻斷mTOR激酶活性調(diào)控蛋白質(zhì)合成。本研究采用AHARIBO蛋白技術(shù)檢測(cè)Torin 2誘導(dǎo)的翻譯抑制效應(yīng):將K562細(xì)胞分為實(shí)驗(yàn)組(AHA孵育期間添加100 nM Torin 2處理1小時(shí))與對(duì)照組(僅AHA孵育),經(jīng)肽段下拉技術(shù)富集AHA標(biāo)記的新合成肽段后,通過LC-MS進(jìn)行定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析。
應(yīng)用方向
1.蛋白質(zhì)合成機(jī)制研究
動(dòng)態(tài)追蹤疾病模型(如癌癥、神經(jīng)退行性疾病)中新生蛋白的時(shí)空表達(dá)特征。
驗(yàn)證mRNA翻譯效率差異,解析非編碼RNA對(duì)蛋白質(zhì)合成的調(diào)控作用。
2.藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證
篩選小分子化合物對(duì)特定通路蛋白合成的抑制/激活效應(yīng)(如抗癌藥物對(duì)癌基因產(chǎn)物合成的阻斷)。
監(jiān)測(cè)抗體藥物誘導(dǎo)的B細(xì)胞受體(BCR)信號(hào)通路相關(guān)蛋白的快速合成。
3.翻譯后修飾(PTM)分析
結(jié)合磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué),研究激酶活性與新生蛋白磷酸化的協(xié)同調(diào)控。
探索新生蛋白的糖基化修飾模式對(duì)免疫原性的影響(如疫苗研發(fā))。
4.病毒學(xué)與感染機(jī)制
定量宿主細(xì)胞在病毒感染后的抗病毒蛋白(如干擾素誘導(dǎo)蛋白)合成動(dòng)力學(xué)。
鑒定病毒劫持宿主翻譯機(jī)器的關(guān)鍵宿主因子(如新冠病毒的ORF1ab蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò))。
5.合成生物學(xué)與蛋白質(zhì)工程
優(yōu)化人工合成基因的翻譯效率,篩選高表達(dá)工程蛋白的宿主細(xì)胞系。
研究稀有密碼子對(duì)新生蛋白折疊速率的影響(如熒光蛋白變體的快速篩選)。
注意事項(xiàng)
1.實(shí)驗(yàn)安全規(guī)范
試劑盒含同位素標(biāo)記成分(如L-賴氨酸-13C?1?N?),需嚴(yán)格遵守放射性/穩(wěn)定性同位素操作規(guī)程,避免交叉污染。
實(shí)驗(yàn)區(qū)域應(yīng)配備通風(fēng)櫥及專用耗材,廢棄物需按生物危害品處理。
2.樣本適用性限制
僅支持真核細(xì)胞系(如HEK293、Jurkat等),不適用于原代細(xì)胞、組織樣本或微生物(除非提前驗(yàn)證)。
細(xì)胞活性需>80%,避免使用凍存或凋亡細(xì)胞,以免影響標(biāo)記效率。
3.操作關(guān)鍵控制點(diǎn)
嚴(yán)格遵循代謝標(biāo)記時(shí)間窗口(通常為4-6小時(shí)),過長(zhǎng)可能導(dǎo)致代謝平衡破壞。
磁珠純化步驟需充分震蕩混勻,避免因結(jié)合效率不足導(dǎo)致假陰性結(jié)果。
4.數(shù)據(jù)分析前提條件
需提供細(xì)胞培養(yǎng)基成分說明(如是否含血清),避免外源性肽段干擾。
建議同步設(shè)置陰性對(duì)照(未標(biāo)記細(xì)胞)和陽(yáng)性對(duì)照(已知高表達(dá)蛋白),提升數(shù)據(jù)可信度。
5.法規(guī)與兼容性
數(shù)據(jù)僅限科研用途,若涉及臨床樣本需另行倫理審批。
兼容主流質(zhì)譜儀(如Thermo Orbitrap、AB Sciex TripleTOF),但需提前確認(rèn)儀器參數(shù)適配性。
常見問題
Q1:系統(tǒng)是否適用于原代細(xì)胞或臨床樣本?
A:當(dāng)前版本主要針對(duì)永生化真核細(xì)胞系(如HEK293、HeLa)優(yōu)化。若需擴(kuò)展至原代細(xì)胞或組織樣本,需提前聯(lián)系技術(shù)團(tuán)隊(duì)評(píng)估可行性。
Q2:LC-MS分析是否需要額外付費(fèi)?
A:12次反應(yīng)套餐已包含基礎(chǔ)LC-MS服務(wù)(含數(shù)據(jù)報(bào)告)。如需高分辨率質(zhì)譜(如Orbitrap)或深度覆蓋分析,可升級(jí)套餐(報(bào)價(jià)詳詢銷售)。
Q3:如何保證實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性?
A:系統(tǒng)內(nèi)置三重質(zhì)控:
同位素標(biāo)記效率驗(yàn)證(CV<5%);
陽(yáng)性對(duì)照肽段(如β-actin)內(nèi)參校正;
數(shù)據(jù)庫(kù)匹配率閾值設(shè)定(≥95%置信度)。
Q4:是否支持多組學(xué)聯(lián)合分析?
A:可與轉(zhuǎn)錄組、磷酸化蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)整合,提供定制化多組學(xué)分析報(bào)告(需額外付費(fèi))。
注:該說明僅供參考,最終請(qǐng)immaginabiotech品牌說明書為準(zhǔn)。
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